Résumé :
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In response to environmental stimuli such as wind, snow, slope or asymmetric crown shape, leaning woody plants form a special tissue, named reaction wood, which allows tree axis reorientation. In angiosperm trees, this reaction wood is associated with tensile strains and consequently has been named tension wood (TW). In poplar, TW is mainly characterized by xylem fibres which are poorly lignified and have an extra thick gelatinous secondary layer, named G layer, in the secondary cell wall. This G layer contains almost completely pure crystalline cellulose with microfibrils oriented nearly parallel to the axis of the fibre. The aim of this experiment is to investigate genome-wide expression patterns in tension wood in response to nyctemeral variation. For this purpose, samples were collected from a kinetic experiment every 6 hours over a period of 24h from young stems inclined. Expression data of the genome-wide were obtained using the poplar Affymetrix array, Using bioinformatics tools, the transcriptomic analysis have identified proteins involved in the regulation of the daily biological rhythm. The level of expression of these candidate genes was verified by RT-PCR semi-quantitative.
En réponse aux stimuli environnementaux, comme le vent, la neige ou la pente, les plantes ligneuses inclinées forment un tissu spécial, nommé le bois de réaction, qui permet à l'arbre de réorienter son axe. Dans les angiospermes, ce bois de réaction est associé à des contraintes de tension et, par conséquent, a été nommé le bois de tension (BT). Chez le peuplier, le BT est principalement caractérisé par les fibres de xylème qui sont mal lignifiées et possèdent une épaisse couche secondaire gélatineuse, appelée couche G, dans la paroi cellulaire secondaire. Cette couche G contient principalement de la cellulose cristalline avec des microfibrilles orientées parallèlement à l'axe de la fibre. L'objectif de ce travail est d'étudier les profils d'expression du génome complet dans le bois de tension dans la réponse à la variation nyctéméral. Pour cela, à partir de jeunes tiges inclinées, des échantillons ont été prélevés en cinétique toutes les 6 heures sur 24 heures. Des données d'expression du génome entier ont été recueillies grâce aux expériences sur puce de peuplier Affymetrix. En utilisant des outils de bioinformatique, ces analyses transcriptomiques ont notamment permis d'identifier des protéines impliquées dans la régulation du rythme biologique journalier. Le niveau d'expression de ces gènes candidats a été vérifié en RT-PCR semi quantitative.
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