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Titre :
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Construction d'une carte génétique à partir d'un pedigree Populus nigra x Populus nigra
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Auteurs :
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R. El Malki, - Auteur ;
INRA, Unité d'amélioration, génétique et physiologie forestières, Orléans (FRA), - Auteur ;
Université d'Orléans, Orléans (FRA), - Auteur
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Type de document :
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thèse/mémoire
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Année de publication :
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2009
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Format :
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27 p.
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Langues:
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= Français
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Mots-clés:
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POPULUS NIGRA
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CARTE GENETIQUE
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MARQUEUR SSR
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POLYMORPHISME SNP
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Résumé :
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La génétique des arbres est plus avancée pour 1es peupliers que pour tout autre groupe d'arbres forestiers. L'intérêt pour les programmes de sélection assistés par marqueurs n'a fait que croître. Les efforts se concentrent sur 1a sélection, non seulement pour l'obtention de caractéristiques améliorées associées à la production, mais aussi pour améliorer la résistance aux attaques des ravageurs et des maladies.C'est dans ce dernier cadre que s'inscrit ce travail, en dressant une carte génétique du peuplier noir à partir d'un croisement P.nigra x P.nigra. Cinq cent soixante douze SNP ont été détectés chez les 2 parents. N d'entre eux ont été génotypés dans la descendance par la technique PAMSA M13 mise au point durant le stage. N marqueurs microsatellites (SSR) ont été également ajoutés. Une première ébauche de carte génétique a été construite comprenant 4 et 3 groupes de liaison respectivement pour chaque parent. Cette carte sera complétée et utilisée pour déterminer dans l'avenir des QTL de résistance à la principale maladie du peuplier: la rouille foliaire.
Tree genetics is more advanced for poplar than for any other group of forest tree. Interest for programs by marker-assisted selection has grown. Efforts are concentrated on the selection, not only to obtain improved characteristics associated with the production, but also to improve resistance to pests and diseases.In this last framework, this work is established, setting up a genetic map of the black poplar from a cross P.nigra x P.nigra. Five hundred and seventy two SNP have been detected between the two parents. N of them have been genotyped in the progeny using PAMSA M13 technique, set up during the training course. N SSR markers have been added. A preliminary genetic map has been constructed including 4 and 3 linkage groups respectively for each parent. This map will be completed and used to determine on the future the QTL for resistance to the main disease of poplar: leaf rust.
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Diplôme :
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Master Sciences et Technologies (Mention : Biologie - Biochimie, Spécialité : Biologie Moléculaire et Cellulaire)
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