Titre : | Improved detection of flavescence dorée and related phytoplasma in the elm yellows group in difficult material, with specific PCR primers that amplify a variable non ribosomal DNA fragment |
Auteurs : | D. Clair ; A. Frelet ; G. Aubert ; E. Collin ; E. Boudon Padieu ; INRA DIJON ; XIII th meeting of the International council for the study of viruses and virus-like diseases of the grapevine (ICVG), Adélaide, AUS, 12-17 March 2000 (2000; AUS) ; CEMAGREF NOGENT SUR VERNISSON RGNO |
Type de document : | article/chapitre/communication |
Editeur : | Adélaïde, AUS : University of Adélaide, 2000 |
ISBN/ISSN/EAN : | 0 643 06600 4 |
Format : | p. 101-102 |
Note générale : |
Sigle : CEMAGREF Sigle : RGNO Diffusion tous publics |
Langues: | = Anglais |
Mots-clés: | ULMUS ; VIGNE ; PATHOLOGIE VEGETALE ; DIAGNOSTIC |
Résumé : |
Les méthodes moléculaires ne sont parfois pas assez sensibles pour détecter de faibles titres de phytoplasmes dans des plantes ligneuses. Afin de mettre au point une méthode fiable de détection en routine de la Flavescence dorée de la vigne dans du matériel végétal dormant, l'INRA de Dijon a créé de nouvelles amorces de type FD9. Utilisées en PCR simple, ces amorces se sont montrées très efficaces pour détecter des phytoplasmes dans des vignes et des ormes symptomatiques. Utilisées en PCR gigogne, elles ont révélé des signaux d'excellente qualité à partir de lamelles de phloème ou de tissus entiers prélevés aussi bien sur tiges que sur racines de plantes dormantes. Leurs profils de restriction se sont révélés aussi informatifs que ceux obtenus à partir de l'amorce FD9 de base. Ces nouvelles amorces seront utiles pour la mise en oeuvre de la certification sanitaire, et pour estimer la variabilité des souches de phytoplasmes du groupe de la Jaunisse de l'orme. Elles ouvrent également d'intéressantes voies de recherche sur les différences sérologiques et les caractères épidémiologiques. Molecular-based methods are sometimes not sensitive enough to detect low-titre phytoplasmas in woody hosts. In order to enable the reliable routine diagnosis of Grapevine Yellows in dormant grapevine material, INRA-Dijon constructed new FD9 primers which, used in one step-PCR, proved very effective for the detection of phytoplasmas in symptomatic grapevine and elm. Used in nested-PCR assays, they provided an excellent signal from phloem chips or whole tissues taken from either canes or roots of dormant plants. Their restriction patterns were shown to be as informative as those from the original FD9 product. The new primers will help in the development of sanitary certification protocols and in the assessment of strain variability in the phytoplasmas of the Elm Yellows-group. They will also be very helpful for research work related to serological differences and epidemic traits. |
Exemplaires (1)
Centre | Localisation | Section | Cote | Statut | Disponibilité |
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Val de Loire | Nogent | Articles/chapitres/communications | D 4404 | Empruntable | Disponible pour le prêt |