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Titre :
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Etude de la variabilité génétique de la résistance partielle du peuplier noir (Populus nigra L.) à différentes souches de l’agent pathogène Melampsora larici-populina Kleb. responsable de la rouille foliaire et validation d’un QTL de résistance partielle
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Titre original:
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Genetic variability for partial resistance in black poplar (Populus nigra L.) to various strains of Melampsora larici-populina Kleb. responsible for foliar rust and validation of a major QTL for partial resistance
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Auteurs :
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Albert, Elise, - Auteur ;
INRA Val de Loire, Unité de Recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières, - Auteur ;
Ecole Supérieure d'Agriculture, Angers (FRA), Organisme de soutenance ;
Agrocampus Ouest (Rennes, FRA), - Auteur
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Type de document :
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thèse/mémoire
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Année de publication :
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2013
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Format :
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53 p.
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Note générale :
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co-encadrée par BASTIEN Catherine,JORGE Véronique
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Langues:
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= Français
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Mots-clés:
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POPULUS NIGRA
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MELAMPSORA LARICI POPULINA
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VARIABILITE GENETIQUE
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ROUILLE FOLIAIRE
;
RESISTANCE PARTIELLE
;
ANALYSE DE QTL
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BLACK POPLAR
;
PARTIAL RESISTANCE
;
FOLIAR RUST
;
QTL
;
STRAIN X GENOTYPE INTERACTION
;
INTERACTION SOUCHE X GENOTYPE
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Résumé :
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La résistance aux rouilles foliaires à Melampsora larici-populina (Mlp) constitue un critère de sélection majeur des peupliers cultivés. Faisant face au contournement de toutes les résistances qualitatives déployées, les sélectionneurs s’intéressent aujourd’hui à la caractérisation des résistances partielles présentes dans les populations naturelles de peuplier noir (P. nigra). A travers la mise en place de tests pathologiques en laboratoire, l’étude réalisée avait pour objectifs de préciser le déterminisme génétique et moléculaire des résistances partielles de P. nigra et de valider les effets d’un QTL majeur hérité d’un clone mâle résistant. Une variation quantitative de la résistance, de fortes variabilités génétiques et des interactions génotype x souche significatives ont été mises en évidence chez 7 clones P. nigra et leurs descendances F1. Une nouvelle composante de résistance « pseudo – quantitative », traduisant une réaction d’hypersensibilité, a été identifiée pour la première fois chez P. nigra. Le QTL précédemment détecté a été validé dans deux nouveaux fonds génétiques, mettant en évidence une forte additivité de l’allèle favorable. Dix-sept nouveaux QTL, avec des effets trait et souche-spécifiques, localisés dans deux régions génomiques différentes et expliquant entre 12 et 86 % des variabilités phénotypiques pour les quatre composantes ont été détectés. Les deux régions identifiées colocalisent avec des zones du génome enrichies en gènes de résistance de type NBS-LR. Les applications en sélection des différents résultats ont été discutées.
Resistance to Melampsora larici-populina (Mlp) is a major breeding objective for cultivated poplars. Facing the overcome of all the qualitative resistances deployed, breeders are now interested in identifying partial resistances in natural populations of black poplar (P. nigra). Using artificial inoculation tests, the study aims to clarify the genetic and molecular determinism of partial resistance in P. nigra and to confirm the effect of a major QTL inherited from a resistant male parent. A quantitative variation of the resistance, a high genetic variability and significant genotype by strain interaction were observed in 7 P. nigra genotypes and their F1 progeny. A new resistance component expressing a hypersensitive reaction was identified for the first time in P. nigra. The QTL previously detected was confirmed in two new genetic backgrounds, showing a high additivity of the favorable allele. Seventeen new QTL, with component and strain- specific effects, explained between 12 and 86 % of the phenotypic variability observed for the epidemiological components. They were located in two genomic regions rich in NBS-LL resistance genes. Breeding applications of the results were discussed.
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Diplôme :
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Diplôme d’Ingénieur en Agriculture de l’Ecole Supérieure d’Agriculture d’Angers,Spécialité : Sciences et Productions du Végétal (SPV) - Amélioration des Plantes (AP)
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En ligne :
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http://prodinra.inra.fr/record/205515
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