|
Titre :
|
Etude fonctionnelle d'un micro ARN potentiellement important pour la formation du bois de tension chez le peuplier
|
|
Auteurs :
|
B. Ayangma, Auteur ;
INRA, Unité d'amélioration, génétique et physiologie forestières, Orléans (FRA), Auteur ;
Université de Tours;UFR de Sciences et Techniques, Tours (FRA), Auteur
|
|
Type de document :
|
thèse/mémoire
|
|
Année de publication :
|
2010
|
|
Format :
|
28 p.
|
|
Langues:
|
= Français
|
|
Mots-clés:
|
POPULUS
;
BOIS DE TENSION
;
TRANSFORMATION GENETIQUE
;
QUANTIFICATION
;
PHYSIOLOGIE DE LA PLANTE
;
MICRO ARN
;
FORMATION DU BOIS
;
REPONSE A UN STRESS
;
STRESS MECANIQUE
;
EXPRESSION DES GENES
;
IDENTIFICATION DE GENES
|
|
Résumé :
|
ln reaction to mechanical stimuli poplar differentiate tension wood a wood with specific properties which allows the tree to recover equilibrium. We are interested in reguiationnal mechanisms controlling this complex biological phenomenon. Among the regulator genes miRNA are candidates poorly studied until now. We investigated the role of ptc-miR408 whose expression is regulated in response to mechanical stimuli. ln a first step we carried out in silico studies to identify potential targets of ptc-miR408 and then we determined their expression patterns through electronic northern analyses. The expression of five selected targets (three GTPases and two plastocyanine-like) was further investigated using quantitative RT-PCR. For these five candidates we did not observe any, significant differences in their expression profile which can indicate a regulation by miR408. We also studied the expression of the promoter ptc-miR408 fused to the gus reporter gene in transgenic wood sectors. We observed an expression of this chimeric gene in various cell types of tension wood: fibes, vessels, cambium, ray cells. The expression study of miR408 in other organs of the plant is in progress. The expression of an anti-sense gene of ptc-miR408 did not allow regeneration of transgenic calli, most probably because of a deleterious effect of the transgene.
En réponse à une contrainte mécanique le peuplier va mettre en place un bois aux propriétés particulières, le bois de tension, qui lui permet de retrouver une position d'équilibre. Nous nous intéressons aux mécanismes régulationnels contrôlant ce phénomène biologique complexe. Parmi les gènes régulateurs les miARN sont des candidats jusqu'à présent peu étudiés. Nous nous sommes intéressés à ptc-miR408 dont l'expression est régulée lors de la contrainte mécanique. Dans une première étape nous avons entrepris d'identifier des cibles potentielles de ptc-miR408 in silico puis de déterminer leur expression par northern électronique. Ces données ont été complétées par une étude d'expression par PCR quantitative pour cinq cibles potentielles sélectionnées (trois GTPases et deux plastocyanine-like). Pour ces cinq candidats nous n'avons pas mis en évidence des différences d'expression significatives pouvant indiquer une régulation par miR408. Nous avons également étudié l'expression du promoteur de ptc-miR408 fusionné à un gène rapporteur gus dans des secteurs de bois transgéniques. Nous avons observé une expression du gène gus dans les différents types cellulaires du bois de tension: fibres, vaisseaux, cambium, rayons. Létude dexpression de miR408 dans d'autres organes de la plante est en cours. L'expression d'un gène anti-sens de ptc-miR408 n'a pas permis d'obtenir de cals transgéniques, laissant supposer un effet délétère du transgène.
|
|
Diplôme :
|
Mémoire de Master (Biologie Végétale Intégrative : Gène, Plante, Agrosystème (BioVIGPA))
|
