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Titre :
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Genetic mapping and resolution of resistance gene clusters in poplar
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Auteurs :
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V. Vlainic, Auteur ;
INRA, Unité d'amélioration, génétique et physiologie forestières, Orléans (FRA), Auteur ;
Université d'Orléans, Orléans (FRA), Auteur ;
Université de Zagreb (HRV), Auteur
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Type de document :
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thèse/mémoire
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Année de publication :
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2012
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Format :
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27 p.
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Langues:
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= Anglais
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Mots-clés:
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MELAMPSORA LARIC-POPULINA
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POPULUS
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ROUILLE FOLIAIRE
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RESISTANCE QUALITATIVE
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RESISTANCE QUANTITATIVE
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CARTE GENETIQUE
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LIAISON
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Résumé :
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Les peupliers hybrides (Populus spp.) sont plantés pour leur productivité et présentent un potentiel pour la production de bioénergie. Toutefois, comme toute espèce longévive, ils sont susceptibles d'être atteints par des agents pathogènes à évolution plus rapide. Melampsora larici-populina provoque la rouille foliaire, l'une des maladies les plus répandues chez les peupliers. Les résistancespeuvent être de type qualitatif ou quantitatif. Des travaux passés ont mis en évidence la présence de gènes majeurs de résistance à la rouille localisés sur le chromosome XIX dans une zone riche en gènes à NBS-LRR. Des marqueurs microsatellites ont été utilisés pour construire les cartes génétiques du chromosome XIX de plusieurs parents P. deltoides. La liaison entre les marqueurs et les facteurs de résistance qui ségrègent depuis ces parents a été testée afin de déterminer la position de plusieurs facteurs de résistance. Ceux-ci sont localisés sur le chromosome XIX, confirmant l'hypothèse initiale. Une corrélation ente résistance qualitative et quantitative a été confirmée à l'aide des marqueurs, mais les données obtenues ne sont pas suffisantes pour déterminer si elle résulte d'une liaison ou d'une pléiotropie. Le génotypage est à compléter car il reste des marqueurs à tester pour conclure de façon plus précise.
Hybrid poplars (Populus spp.) are extensively cultivated for their productivity and have a potential for bioenergy production. However, being a long-lived species, they are prone to attack by pathogens with much quicker evolutionary rates. Melampsora larici-populina is a cause of leaf rust, one of the most widely distributed diseases in poplar. The resistances can be defined as qualitative or quantitative. Previous studies have found several resistance genes in poplar, related to the resistance to leaf rust, localized on the chromosome XIX in an area rich in NBS-LRR genes.Polymorphic microsatellite markers were used to construct genetic maps of chromosome XIX of several P. deltoides parents. The linkage between the markers and resistance factors segregating from these parents was tested in order to gather information on the position of several resistancefactors. Results showed that they are positioned on chromosome XIX, confirming the initial hypothesis. Correlation between qualitative and quantitative resistance was confirmed using markers, but the data obtained were insufficient to say whether it is the result of linkage or pleiotropy. The genotyping was not yet completed because there are still some markers to be tested in order to be able to make firmer conclusions.
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Diplôme :
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Mémoire de Master (Biologie-Biochimie, Techniques bio-industrielles)
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